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    發布時間:2015-07-23 11:13 原文鏈接: Nature、Science:別讓問題試劑毀了你的研究

      高質量的化學試劑在生物學研究中起到了至關重要的作用。一群頂尖科學家日前在Nature Chemical Biology雜志上發表文章指出,許多研究者正在無意中使用低劣的化學試劑,結果得出了錯誤的研究結論。這不僅是人力、物力和財力的極大浪費,還嚴重耽誤了新藥的開發。

      “糟糕的試劑產生糟糕的科學,這不僅是金錢上的浪費,還糟蹋了我們的事業,”結構基因組聯盟的生物化學家Aled Edwards說。盡管有不少文獻報告過出現問題的化學試劑,但這些試劑仍在被不少人使用。“現有做法無法解決這樣的問題,我們在這方面的信息交流出現了系統性故障。”

      科學家們為此建立了一個Chemical Probes Portal網站,希望幫助研究者們選擇質量更好的研究工具,避免研究出現意想不到的錯誤。Nature、Science紛紛對這一新鮮事物進行了報道。

      化 學探針是可以特異性結合并有效調節目標活性的小分子。高質量化學探針在生物學研究中是很有價值的,在分子生物學和遺傳學領域得到了廣泛的應用。化學探針有 助于在分子水平上準確理解目標分子及其相關通路,人們用化學探針來抑制(或者激活)特定蛋白,以確定這些蛋白在細胞或機體中承擔的功能。此外,化學探針還 是強大的藥理學工具,將基礎研究和轉化醫學連接起來。研究者可以通過化學探針做出決定,是否進入時間長而且成本高的藥物開發。

      文 章指出,正確的化學工具能使人們獲得新的生物學知識,有助于把新發現轉化為新藥物,并最終用于臨床治療。但劣質的化學探針會造成非常嚴重的問題,誤導研究 者們得出錯誤的結論。舉例來說,一些探針會產生副作用,使蛋白發生化學改變,或者導致蛋白聚集而危害細胞。還有一些探針能與目標以外的蛋白結合,產生很大 的脫靶效應。這些探針會影響細胞中的大量蛋白,對于生物醫學研究來說根本是沒有用的。

      研究者們在尋找新探針的時候,往往是去查找文獻,而且傾向于使用引用次數最多的探針。但這些探針往往比較老,并且性能并不可靠。文章指出,傳統搜索引擎并不能有效幫助研究者找到最好用的研究工具。Chemical Probes Portal是一個可以分享心得體驗的平臺,研究者們可以從中獲得化學探針的最新信息,根據其他人的實際經驗選擇最適合自己的探針。

      這篇文章列出了一些劣質或過時的化學探針,其中就包括LY294002。LY294002已經問世二十年了,被用來選擇性抑制癌癥中的一類重要蛋白(PI3激酶)。2004年以來,越來越多的證據表明LY294002存在不容忽視的脫靶問題。LY294002雖然被大量引用,“但它其實是個糟糕的探針,已經過時十年了而且脫靶效應大,” 文章的共同作者,英國癌癥研究中心的負責人Paul Workman教授指出。實際上更精確的探針已經面世好多年了,但還有商家將LY294002作為PI3激酶抑制劑售賣,不少研究者們仍在使用它。

      文章還指出,對化學探針的錯誤認識,導致每年有數以千計的研究論文得出不準確甚至錯誤的結論。幾年前,劣質探針生成的數據讓一個III期臨床試驗遭遇滑鐵盧。研究人員對候選癌癥藥物iniparib進行了多年研究,花費了大量的時間和金錢,共有五百多名患者接受了藥物治療。然而這種藥物并沒有起到預期的作用,于2011年徹底失敗。

      科學家們認為,Chemical Probes Portal不僅能為研究者們提供寶貴的信息,也應當被學術期刊的編輯和審稿人重視起來。另外,化學試劑的供應商也應當為其客戶提供更詳細更準確的信息。

      “化 學探針對于生物醫學研究和藥物研發來說是至關重要的,但許多我們正在使用的許多探針實際上名不副實。這個普遍存在的現象,正在暗暗破壞科學研究的質量,產 生誤導性結果,浪費人們的時間和金錢,阻礙新癌癥藥物的問世。這是一個迫切需要解決的問題,我們希望能夠這個網站提供的探針使用信息,能夠在這方面有所幫 助,”Workman教授指出。

      “我們這個網站可以為研究者們提供最新、最可靠的信息,幫助他們在研究中選擇和使用最好的探針,造福整個科研群體。藥物研發和臨床試驗必須建立在堅實的基礎之上,”英國癌癥研究所的Julian Blagg說。

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