NatureMethods發布新RNA測序技術

　　Santa Cruz公司和Rochester大學的研究人員開發了一種新的RNA測序技術。他們通過這一技術發現了許多此前未被檢測到的調控性小RNA。這一成果發表在八月三日的Nature Methods雜志上。

　　這個新技術可以在細胞中靈敏檢測到帶有化學修飾（甲基化）的小RNA。“tRNA是生物體內含量最豐富的小RNA之一，細胞里到處都是tRNA片段。但因為RNA修飾，標準的分析方法遺漏了許多tRNA，”文章的第一作者Aaron Cozen說。

　　這一方法為人們打開了RNA研究的一塊新天地，“我們檢測到的tRNA比過去多三倍，”文章的資深作者，Todd Lowe教授說。

　　早在數十年前人們就發現了tRNA，一直以來tRNA被認為主要在蛋白質翻譯中起作用，與mRNA、rRNA合作根據DNA編碼的遺傳指令合成蛋白質。隨著RNA干擾和microRNA調控機制的發現，科學家們開始重新認識RNA在基因調控和其他細胞功能中扮演的角色。近年來人們發現了越來越多不同種類的小RNA，并在不斷探索它們的作用機制。

　　“過去五年，我們已經意識到tRNA的功能不只是蛋白質翻譯。被切割成片段的tRNA應該還在細胞中承擔了其他的功能，”Lowe說。“舉例來說，前不久有研究發現，一些tRNA片段能夠抑制乳腺癌的發展。”

　　高通量測序技術可以用來檢測和分析tRNA，但這種方法會受到RNA甲基化的影響，而甲基化在tRNA中是很普遍的。研究人員為此開發了一種酶學方法，可以在測序之前去除這些修飾。

　　為了得到更準確的信息，研究人員還開發了一個測序數據的分析工具，對tRNA的甲基化修飾進行鑒定和定位。他們用自己的方法在酵母中準確預測了一些已知的tRNA修飾。隨后他們又將這一技術用于人類細胞，發現了大量此前未知的tRNA修飾。

　　“過去的研究顯示，人類基因組中只有10%-15%的tRNA存在甲基化修飾。我們檢測到的tRNA修飾要多得多，對相關研究是很有幫助的，”Lowe說。