GRAIL癌癥早篩：利用cfDNA甲基化分析方法可溯源20余種癌癥

　　2019年9月27日，歐洲腫瘤內科學會（ESMO）年會在西班牙巴塞羅那拉開帷幕。ESMO是歐洲最負盛名和最具影響力的腫瘤學會議，眾多臨床機構及領先企業在本屆年會上公布了腫瘤領域的最新轉化研究及臨床實踐數據。

　　9月28日，美國癌癥早篩公司GRAIL在ESMO年會上重磅發布了該公司基于cfDNA的靶向甲基化液體活檢分析方法在癌癥早篩領域的最新研究數據。這項多中心研究結果顯示，通過對cfDNA的癌癥相關甲基化模式進行分析，該公司方法能夠檢測和定位超過20種類型的癌癥，且具有較高的準確性。來自美國Dana-Farber癌癥研究所的Geoffrey R. Oxnard博士在會上對最新數據進行了口頭報告。

　　GRAIL希望在尚未出現癥狀的癌癥患者血液中尋找腫瘤DNA的蛛絲馬跡，進而對癌癥進行早期篩查和診斷。為了實現該目標，GRAIL所啟動的臨床試驗“循環游離基因組圖譜研究”（Circulating Cell-free Genome Atlas，CCGA）是迄今為止規模最大的臨床項目之一。在這項試驗中，GRAIL使用多種策略對受試者血液樣本進行分析，探索血液游離DNA表達模式和水平變化，幫助其開發癌癥早篩產品。去年，該公司分別在AACR及ESMO年會上公布CCGA研究第一個預試驗的研究數據，顯示其基于三種原型檢測技術的早篩方法在不同類型癌癥具有高度特異性。此外，在今年6月的ASCO年會上，該公司數據顯示，其檢測方法能夠在癌癥早期階段檢測到12種致命癌癥的強烈信號，其特異性至少達到99%，并能高精度地識別癌癥的組織來源。

　　“大多數癌癥直到晚期才被發現，而癌癥仍然是全球第二大死亡原因。為了應對這一挑戰，我們啟動了基因組醫學領域最具雄心的臨床研究項目之一，以支持一種新型的泛癌種早期檢測方法，”GRAIL臨床開發副總裁Anne-Renee Hartman博士表示。“我們很高興能夠展示我們大規模、嚴密的臨床研究項目的最新數據，這些數據證明我們的檢測方法利用單次采血，就能夠檢測出各個階段的20多種類型癌癥，并確定癌癥位于身體的部位，同時將假陽性降至最低。”

　　據悉，在這項多中心臨床試驗中，研究人員對3,583份血液樣本的cfDNA進行了分析，包括1,530例被診斷患有癌癥患者的樣本和2,053例無癌志愿者的樣本。其中癌癥患者的血液樣本涵蓋了20余種不同癌癥類型，包括HR陰性乳腺癌、結直腸癌、食管癌、膽囊癌、胃癌、頭頸癌、肺癌、淋巴白血病、多發性骨髓瘤、卵巢癌和胰腺癌等。研究結果顯示，該方法的總體特異性為99.4％，這意味著只有0.6％的假陽性結果；總體靈敏度為54.7%（95% CI: 52.2%-57.2%）。對于預先指定的高死亡率類型癌癥（約占美國癌癥死亡63%的14種癌癥），該方法的靈敏度為75.8％（72.9%-78.5%）；I期癌癥患者的靈敏度為32％，II期患者為76％，III期患者為85％，IV期患者為93％。此外，該方法還能在97%的樣本中精確定位腫瘤的器官或組織來源，89%的返還結果被證明為正確溯源結果。這種跨越20余種不同腫瘤類型的精確溯源能力為簡化后續診斷提供了有力保障，展示了該方法在早篩領域的廣闊應用前景。

　　值得關注的是，與檢測DNA中的基因突變或其他癌癥相關改變的液體活檢方法不同，GRAIL的靶向甲基化分析方法著重于對ctDNA異常的甲基化修飾進行分析。事實證明，在許多情況下，甲基化的異常模式比突變更能說明癌癥和癌癥類型。該研究領導者Geoffrey Oxnard博士表示：“我們此前的工作表明，基于甲基化的檢測方法在利用血液樣本檢測多種形式癌癥上優于傳統的DNA測序方法。這項最新研究結果表明，這種檢測方法是篩查癌癥患者的一種可行方法。”

　　根據GRAIL公布的信息，該公司的高效甲基化技術能夠優先針對基因組信息最豐富的區域，并利用其專有的數據庫和機器學習算法來檢測癌癥的存在并識別腫瘤的組織來源。此外，該公司的癌癥及非癌癥甲基化特征測序數據庫被認為是同類數據庫中規模最大的，涵蓋了整個基因組中約3000萬個甲基化位點，涉及超過20種不同階段的癌癥類型。這也為該公司開發可靠的癌癥甲基化分析方法提供了有力的基礎。

　　GRAIL表示，未來該公司還將陸續發布來自其在研項目的其他新數據，相關獨立驗證結果將于下月進行展示。

　　參考資料：

　　1. GRAIL to Present New Data in Late-Breaking Oral Presentation at the European Society for Medical Oncology (ESMO) 2019 Congress

　　2. Multi-cancer detection of early-stage cancers with simultaneous tissue localization using a plasma cfDNA-based targeted methylation assay

　　3. New blood test capable of detecting multiple types of cancer