最基本的毛細管柱由兩部分組成：管線和固定相。熔融石英（管外涂漬了聚酰亞胺）和不銹鋼是管線的主要材料。
有各種各樣的固定相，大多數是高分子量、熱穩定性好的聚合物，這些聚合物是液體或膠。這一類固定相中最常用的是聚硅氧烷和聚乙二醇。次常用的固定相是小的多孔顆粒，由聚合物和沸石（例如：氧化鋁、分子篩）組成。
