實際應用案例
近日,Scott E. Wolkenberg博士團隊利用藥明康德HitS事業部自主開發并運維的DELFinder搜索引擎和DELopen平臺,順利完成DEL相關領域論文的檢索工作,并成功在《ACS Medicinal Chemistry Letters》雜志上發表論文。
近年來興起的DNA編碼化合物庫(DNA-Encoded Library)技術,基于獨特的組合化學原理,將小分子化合物和DNA標簽相結合,受到越來越多學術界和工業界藥物研發人員的關注與青睞,在新藥發現領域發揮著越來越重要的作用。
由于DEL技術是化學、生物學、信息學的多學科跨界創新產物,通過主流數據庫來檢索相關文獻,會遇到很多的干擾信息,想找有用的資料來了解和學習DEL技術困難重重。
2020年1月3日,DELopen團隊自主開發并上線了一款專用于DEL領域的學術搜索引擎——DELFinder,免費為全球研發人員提供關于DEL技術的數據信息檢索服務。
近日,Scott E. Wolkenberg博士團隊使用DELFinder工具,完成DEL相關論文的檢索工作,并在ACS Medicinal Chemistry Letters雜志上發表了綜述性文章《Trends in Hit-to-Lead Optimization Following DNA-Encoded Library Screens》[1]。
該篇綜述首先對DEL篩選和傳統的HTS(High Throughput Screening,高通量)篩選進行簡要概述和對比,同時檢索并篩選大量已發表的DEL篩選和HTS篩選相關文獻,通過歸納和分析大量文獻數據,類比了由DEL篩選或HTS篩選獲得的苗頭化合物以及后續的先導化合物優化的流程和效果,具體分析了包括BRD4、DDR1和BETm等靶點的優化案例。
值得注意的是,該篇綜述同時使用了SciFinder和DELFinder進行文獻檢索和收集。其中,2016-2020年間的DEL技術相關文獻均來自于DELFinder的檢索結果。
在楊森(Janssen)公司研發部工作的Wolkenberg博士高度認可由藥明康德HitS事業部開發并運維的DELFinder搜索引擎和DELopen平臺,并評論道:“DELopen平臺的資源非常棒,衷心感謝藥明康德團隊為此做出的努力和貢獻。”
由DELopen團隊開發的學術搜索引擎——DELFinder,致力于為全球研發人員提供所有關于DEL技術的數據信息檢索服務[2]。
DELFinder收錄了公開報道的與DEL相關的所有文獻、ZL、書籍、博士論文、會議論文、行業新聞、臨床報告等數據信息。研發人員可以通過篩選條件,如文獻類型、企業/學術機構、發表日期、數據庫來源等,或者輸入關鍵字,快速、精準地檢索到想要的DEL相關文獻或報道,通過提供的原文鏈接獲得相關信息,從而學習和追蹤DEL技術的研究進展和最新應用。
為滿足全球科研用戶的需求,DELFinder不斷升級迭代。
最新版DELFinder 2.0的檢索界面:不僅會顯示文章信息,該文獻相關的DEL Library,DEL Hit及DNA Compatible Chemistry也會被明確列在檢索到的文獻頁,并配以簡明圖示,輔助用戶快速理解文章。真正做到不用登錄,無需閱讀原文,即可輕松掌握每篇文獻的關鍵信息,大大縮短了精準檢索所需文獻的時間[3]。此外,DELFinder 2.0中的推薦指數也為用戶篩選全球最前沿最優質的DEL科研成果提供了便利。
DELopen平臺是藥明康德HitS事業部基于合作、賦能、創新等理念,聯合醫藥研發領域頂級學術研究機構共同發起的、致力于推動DEL技術應用和開發的開放式新藥研發合作平臺。
DELopen平臺的突出特點是其公益性和互動性。它面向的是全球所有高校、研究所和非盈利組織等學術機構,科學家們可以通過DELopen平臺與工業界合作,利用DEL技術高效地完成早期藥物發現,協作推動全球生物制藥領域科學和技術的發展,最終造福廣大病患。
而依托DELopen平臺的“DELopen新藥篩選包”,是藥明康德HitS事業部于2018年12月推出的自助式DEL篩選試劑盒,現已服務全球百余家學術機構,多個機構已經成功找到相關靶點的苗頭化合物(Hit),并成功開啟后續的藥物研發工作。藥明康德“DELopen新藥篩選包”項目榮獲第五屆 “社會價值共創”優秀獎[4]。