鼠斑疹傷寒主要與流行性斑疹傷寒鑒別,其病原體為普氏立克次體,傳染源為患者,以體虱為媒介,多發于冬春季,呈流行性。癥狀與地方斑疹傷寒相似,但病情較重,皮疹多,出血性多見,神經系統癥狀明顯,普氏立克次體凝集反應陽性。本病還需與流感、恙蟲病、鉤端螺旋體病等區別。