黃粉甲觸角轉錄組測序及嗅覺基因鑒定在鞘翅目嗅覺基因功能研究中的應用
最新一期《Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics》（SCI收錄，IF=2.823）雜志報導了安徽農業大學植保學院的研究人員在昆蟲轉錄組測序方面的研究論文，該課題組利用第二代高通量測序技術對黃粉甲觸角組織進行轉錄組測序，并鑒定出數十條編碼嗅覺蛋白的基因。安徽農業大學植保學院的劉蘇博士和李世廣博士分別是本文的第一作者和通訊作者。
背景介紹
昆蟲靈敏的嗅覺在其生存與繁衍中扮演重要角色。與高等脊椎動物不同，昆蟲的嗅覺系統較為復雜，有多個嗅覺蛋白家族參與其中，如氣味結合蛋白OBPs、化學感受蛋白CSPs、氣味受體ORs、離子型受體IRs、感覺神經元膜蛋白SNMPs等。目前，針對昆蟲嗅覺蛋白編碼基因的研究，多集中于鱗翅目昆蟲，而針對鞘翅目昆蟲的研究較少。
結果分析
該課題組使用Illumina HiSeq2000測序平臺對黃粉甲（Tenebrio molitor，一種鞘翅目昆蟲）進行轉錄組測序，使用CLC Genome Workbench軟件（版本6.0.4）進行序列拼接。轉錄組測序獲得了52,216,616條clean reads，拼接獲得了35,363條unigenes。這些unigenes平均長度451 bp，N50值為505 bp。其中18,820條unigenes與NCBI nr蛋白質數據庫中已注釋的蛋白能夠較好地匹配（E-value<10-5）。Gene ontology（GO）和Cluster of Orthologous Groups（COG）也被用于分析這些基因的潛在功能。在35,363條unigenes中，有13,010條（36.79%）能夠匹配上至少一個GO的分子功能，而能夠匹配上至少一個COG功能的unigenes為11,544條（32.64%）。在黃粉甲觸角轉錄組中鑒定出了19個OBP基因，12個CSP基因，20個OR基因，6個IR基因，2個SNMP基因。本研究是首次對黃粉甲觸角進行轉錄組學研究。上述研究成果為深入研究鞘翅目嗅覺基因的功能奠定了堅實的基礎。本課題中的轉錄組測序與分析服務由上海伯豪生物技術有限公司提供。
原文出處：Liu S, Rao XJ, Li MY, Feng MF, He MZ, Li SG. Identification of candidate chemosensory genes in the antennal transcriptome of Tenebrio molitor (Coleoptera: Tenebrionidae). Comp. Biochem. Physiol. D 2015, 13: 44-51.