鞭毛（flagellum）長在某些細菌菌體上細長而彎曲的具有運動功能的蛋白質附屬絲狀物，稱為鞭毛。鞭毛的長度常超過菌體若干倍。少則1-2根，多則可達數百根。
原生質神經伸出細胞外形成的鞭狀物，一條或多條，有運動、攝食等作用。鞭毛蟲以及各種動植物的精子等都有鞭毛。是常見的細菌細胞器之一。
在某些菌體上附有細長并呈波狀彎曲的絲狀物，少則1-2根，多則可達數百根。這些絲狀物稱為鞭毛，作用是負責細菌的運動。
從一些原核細胞和真核細胞表面伸出的、能運動的突起。鞭毛較長，數目少；纖毛與鞭毛有相同的結構，但較短，數目多。細菌的鞭毛則有完全不同的結構。
鞭毛一般長約150微米，纖毛5～10微米，兩者直徑相近，為0.01～0.03微米。大多數動物和植物的精子都有鞭毛。精子及許多原生動物都以鞭毛或纖毛為運動器。
具有鞭毛的細菌大多是弧菌、桿菌和個別球菌。
細胞表面的細長鞭狀原生質突起，其功能為運動、攝食等，某些細菌菌體的一端、兩端或周圍也有鞭毛。主要類型有尾鞭型、茸鞭型等。尾鞭型：鞭毛的一種類型。在電鏡下觀察，鞭毛表面無茸毛(或鞭茸)。常見于綠藻門、輪藻門游動孢子或精子的鞭毛，高等植物中的苔蘚和蕨類的精子均為尾鞭型的鞭毛。還有一些藻類和低等真菌的游動細胞具1條尾鞭型的鞭毛和1條茸鞭型鞭毛。茸鞭型：鞭毛的一種類型。在電鏡下觀察，鞭毛表面具許多羽狀排列的茸毛(或鞭茸)。常見于裸藻、隱藻門的種類。在甲藻、褐藻以及一些低等真菌中，常見在同1個游動細胞上具1條茸鞭型鞭毛，另1條為尾鞭型鞭毛 。