間充質干細胞是一種多能干細胞，它具有干細胞的所有共性，即自我更新和多向分化能力。在臨床應用也最多，與造血干細胞聯合應用，可以提高移植的成功率，加速造血重建。當患者接受大劑量化療后，將間充質干細胞與造血干細胞一同輸入，可明顯加速患者血細胞恢復時間，且安全無不良反應。
間充質干細胞不僅存在于骨髓中，也存在于骨骼肌、骨外膜和骨小梁中。由于它分化的組織類型十分廣泛，因此臨床應用價值不菲。
