時間控制：
時間控制是指當設備運行到達設定的再生時間時自動啟動再生過程；這類系統是根據實際用水量及設備交換能力來設定再生時間的，用戶可以將再生過程選在在用水量較少的時段，也可以根據需要隨時以手動方式啟動再生過程。[9]
時間控制的優點：1)價格便宜；2)易于操作
時間控制的缺點：1)一般每24小時才能再生一次；2)無法根據實際使用狀況精確確定再生的時間點
適用場合：時間型控制一般應用在硬度較低(<4mmol/L)，用水量穩定(用水波動不超過15%)、出水要求不高、用水量較小的情況。
流量控制
流量控制是根據設備的交換能力(總產水量)來設定運行終點。設備運行時由專用的流量計來對流出的水量進行統計。當總出水量達到設定的水量時，控制器就自動開始再生過程。設定前應根據樹脂總裝填量、生水硬度計算出每個周期的總產水量，按該值進行設定(960系列的產水量是由控制器自動計算出的)。當達到設定水量后，可根據需要立刻進行再生或等待至某一設定時刻后再進行再生。
流量控制的主要特點：
1)再生以流量控制，精確度高。消耗可降至最小，運行經濟可靠；
2)后備電池及內置記憶功能，停電不需重新進行數值設定；
3)再生過程每個步驟的時間都可根據需要設定；手動再操作輕松啟動新的運行周期；
4)數字化設置及顯示，可顯示出瞬時流量、周期剩余水量、再生時的剩余時間等信息，一目了然。
適用場合：這種系統更能適應用水量及水質波動的情況，控制更加準確穩定。更適用于燃油、燃汽鍋爐、中央空調等要求較高的用水情況[10]。