酶的活性部位在酶的催化機制中的作用:由于酶的活性部位與底物結合后，能使底物作用濃度相對增加，易于反應(稱為鄰近效應，Proximity);或使底物功能基團受酶影響，作定向轉移 (Orientation)，更有利于催化作用發生;或活性部位內的催化基團提供質子或吸收質子，呈現酸堿催化劑的作用;或形成一個以共價鍵相結合的活潑中間物，降低活化能;或使底物分子中某些化學鍵受到牽拉變形而易斷裂(又稱底物形變，Strain，Distortion)，這些因素相互配合，使催化效率大為提高。
