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    發布時間:2015-05-19 15:17 原文鏈接: 謝曉亮JAMA暢談單分子生物學

      當單分子遇上基因組學,它們會擦出什么樣的火花?著名華人學者謝曉亮(Sunney Xie)博士圍繞這個話題,在《美國醫學會雜志》(JAMA)上發表了文章。謝博士現任哈佛大學化學及化學生物學系教授,也任北京大學生物動態成像中心主任。

      謝博士寫道,單分子成像和操作的進步導致了單分子生物學的出現。由于全世界多個實驗室的努力,單分子生物學已經改變了解決問題的方式,并產生了許多新的知識。

      他舉了早期一個膽固醇氧化酶的例子。這種酶包含黃素基團,在氧化形式下發出熒光,而在還原形式下不發熒光。熒光的每個開/關循環對應于酶促循環,實現了酶促反應的實時觀察。在單分子基礎上,化學反應以隨機方式發生(即發生化學反應的等待時間是隨機的),而不是像大量分子那樣是確定性的。

      謝博士認為,這種實時觀察單分子化學反應的能力非常重要,因為許多分子(如DNA)在活細胞中以單分子(染色體)存在,這意味著基因組中的變化是隨機的。因此,個體中每個生殖細胞都是不同的,而原發性腫瘤中的癌細胞也是高度異質性的,這使得單細胞測序成為必需。

      不過,單細胞基因組的測序需要全基因組擴增。為此,謝博士及其同事開發出單細胞基因組MALBAC擴增技術,與目前廣泛使用的多重置換擴增相比,提供了更加準確的拷貝數變異和單核苷酸變異檢測。

      目前,MALBAC技術已經應用在體外受精和癌癥診斷上。為了協助體外受精,MALBAC現已應用于胚胎植入前基因組篩查(PGS)和胚胎植入前遺傳學診斷(PGD),以避免染色體異常和單基因疾病的遺傳。

      與之前應用于PGS和PGD的技術相比,MALBAC帶來了更高的精確度,能同時避免染色體異常和點突變。2014年,首例經MALBAC進行單基因遺傳病篩查的試管嬰兒出生,不患有父親所攜帶的單基因遺傳病。這為那些患有遺傳疾病的夫婦帶來了令人激動的消息。

      此外,謝博士也表示,MALBAC也已經用于循環腫瘤細胞的測序。在分析肺癌患者的循環腫瘤細胞時,人們發現,與高度異質的點突變不同,同一患者循環腫瘤細胞中的拷貝數變異是相似的,同一癌癥類型的不同患者也相似,但不同類型的癌癥就明顯不同。這為基于拷貝數變化模式的無創癌癥診斷帶來了可能。

      謝博士認為,計算單細胞中的拷貝數和檢測點突變的能力不僅是可能的,而且是極為重要的。這種單分子方法能夠在單分子水平上探索、了解并改善生命,也為精準醫療提供了一個具體的例子。

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