EST是從一個隨機選擇的cDNA克隆進行5’端和3’端單一次測序獲得的短的cDNA部分序列,代表一個完整基因的一小部分,在數據庫中其長度一般從20到7000bp不等,平均長度為360±120bp 。
EST來源于一定環境下一個組織總mRNA所構建的cDNA文庫,因此EST也能說明該組織中各基因的表達水平。