實驗原理
印跡法一般由凝膠電泳；樣品的印跡和固定化；各種靈敏的檢測手段如抗體、抗原反應等三大實驗部分組成。
生物大分子凝膠電泳分離 蛋白質印跡法的第一步一般是將蛋白質進行SDS聚丙烯酰胺平板凝膠電泳，使待測蛋白質在電泳中按相對分子質量大小在板狀膠上排列。
2.分子區帶的轉移和固定 第二步就是反凝膠電泳已分離的分子區帶轉移并固定到一種特殊的載體上，使之形成穩定的、經得起各種處理并容易檢出的，即容易和各自的特異性配體結合的固定化生物大分子。
3.特異性譜帶的檢出 印跡在載體上的特異抗原的檢出依賴于抗體、抗原的親合反應。即將酶、熒光素或同位素標記的特異蛋白分別偶聯在此特異抗體的二抗上，再分別用底物直接顯色，測熒光，放射自顯影等方法檢測出我們感興趣的抗原，考慮到如果無合適抗體用來檢測抗原時，可用一般的蛋白染料，如麗春紅，檢測轉移到膜上的蛋白，驗證轉移是否成功。
實驗步驟
I SDS－PAGE電泳分離蛋白
II 電轉移
戴手套將硝酸纖維素紙裁成和需印跡凝膠相似而略大的小塊。
2.將SDS－PAGE后準備印跡的凝膠塊和硝酸纖維素紙分別放入裝有印跡緩沖液的小塑料盒里漂洗10 min。
3.將濾紙裁成比凝膠和硝酸纖維素紙略大的小塊，并做成“三明治”狀，放入轉移夾中。
4.印跡槽中倒入印跡液，將印跡夾放入，膠朝負極，NC膜朝正極，印跡時電流從負極到正極，即將膜上的蛋白質印跡到NC膜上。
5.電印跡：接通電源，使電流達300 mA，同時通冷凝水，印跡2小時后，切斷電源。
III 特異性譜帶的檢出（當無特異抗體時可用此方法）
NC膜的染色和脫色：
印跡完畢，用鑷子小心取出NC紙，放置于塑料盒中。
2.用麗春紅染色5分鐘，用水輕輕漂洗數次至背景紅色消失。