藻類自動分析儀是一種用于環境科學技術及資源科學技術領域的海洋儀器，于2016年5月26日啟用。
技術指標
主要技術參數： 1生物數量：±0.1%f.s（全量程的0.1%） 2 圖像：大小量程：2μm～3mm，分辨率：0.5μm 3 測量流速：0.005ml/min～20ml/min 4激光系統：488nm固態綠色激光 5圖像類型：24位真彩色 (彩色CCD) 6拍照速度：每分鐘可以獲取10000個顆粒的圖像數據。
主要功能
藻類自動分析儀具備完成水中藻類分析的功能，具有顯微攝像、動態圖像、自動計數、體積監測的功能，可滿足長期、穩定地進行海洋生物、淡水生物監測等工作。藻類自動分析儀同時接入流式影像系統、熒光體積監控系統的功能，可同時測量并記錄每個顆粒的ESD、ABD、長度、寬度、長寬比和（或）熒光特性以及同性顆粒的數量和濃度等多達近40個參量的數字特征信息，可為浮游植物生態學調查提供了快速有效的數據分析手段。