薄層數碼成像分析技術是利用數碼成像設備獲得薄層板上各點的光強度信息，之后對獲得圖像進行分析的薄層分析技術。數碼成像設備包括兩種：照相機和掃描儀（由于數碼掃描儀采用逐行成像技術，為便于區分傳統薄層掃描儀的逐點掃描，將數碼掃描儀稱為逐行掃描儀）。
和傳統薄層掃描一樣，照相機或逐行掃描儀都具有光檢測系統，它們都是將光量線性轉化為電信號的元件。不同的是，照相機和逐行掃描儀可進一步將電信號轉換成電腦圖像，圖像中單個點（像素）的顏色深淺反映了光的強弱。
因此，薄層數碼成像更接近人眼觀察檢測，結果更直觀，因此非常適合鑒別，特別是中藥指紋圖譜的識別。
數碼成像儀不僅能完成普通白光照射下的成像分析，再裝配254nm或365nm紫外燈后，也可以檢測特異熒光，特異熒光檢測。