可溶性
菜籽固醇水溶性低而具有高辛醇-水分配系數，這意味著在環境系統中，菜籽固醇會與固相層相關聯。
降解
菜籽固醇在厭氧底層和底泥中可以穩定存在上百年，使之可以指示過去存在藻類的量。
化學分析
圖1 質譜圖
由于該分子含有羥基，經常會與其他脂質（如丙三醇）等相關聯。因此，大多數分析方法都采用強堿(KOH 或 NaOH)來皂化該酯連接。典型的提取方法包括6% KOH的甲醇。自由固醇則會從極性脂質分離出來，進入到弱極性的溶液中 （e.g, hexane)。在分析之前，羥基經常會被BSTFA（bis-trimethyl silyl trifluoroacetamide）替換以代替不易被替換的三甲基硅烷基（TMS）的H。 儀器分析多進行于GC-FID或者GC-MS。圖1可以看到菜籽固醇的TMS乙醇質譜圖。