1、總RNA抽提(槍頭和離心管均經過濕熱滅菌,無RNA酶)
1)取勻漿器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上預冷。
2)取100mg組織,加入到勻漿器中。
3)充分研磨直至無可見組織塊。
4)12000rpm離心10min取上清。
5)加入250 μl三氯甲烷,顛倒離心管15s,充分混勻,靜置3min。
6)4℃ 下12000rpm離心10min。
7)將上清轉移到一新的離心管中,加入0.8倍體積的異丙醇,顛倒混勻。
8)-20℃ 放置15min。
9)4℃下12000rpm離心10min,管底的白色沉淀即為RNA。
10)吸除液體,加入75%乙醇1.5ml洗滌沉淀。
11)4℃下12000rpm離心5min。
12)將液體吸除干凈,將離心管置于超凈臺上吹3min。
13)加入15μl無RNA酶的水溶解RNA。
14)55℃ 孵育5min。
15)使用UV1800檢測RNA濃度及純度:儀器空白調零后取2.5μl 待測RNA溶液于檢測基座上,放下樣品臂,使用電腦上的軟件開始吸光值檢測。
16)將濃度過高的RNA進行適當比例的稀釋,使其終濃度為200ng/μl.左右。
2、反轉錄(槍頭和PCR均經過濕熱滅菌,無RNA酶)
1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。
2)加入1μl 逆轉錄引物。
3)用無核糖核酸酶的去離子水補足至12μl。
4)于PCR儀上65℃ 保溫5min,迅速置冰上冷卻。
5)依次加入4μl 5×buffer,2μl 10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反轉錄酶,用槍抽吸混勻。
6)于PCR儀上42℃保溫60min,結束后80℃保溫5min滅活反轉錄酶。
3、定量PCR
1)取0.2ml PCR管,配制如下反應體系,每個反轉錄產物配制3管。
2× qPCR Mix12.5μl
7.5μM基因引物2.0μl
反轉錄產物2.5μl
ddH2O8.0μl
2)PCR擴增
預變性95℃,10min
循環(40次) 95℃,15s→60℃,60s
熔解曲線75℃→95℃,每20s升溫1℃
4、結果處理
ΔΔCT法:
A=CT(目的基因,待測樣本) -CT(內標基因,待測樣本)
B=CT(目的基因,對照樣本) -CT(內標基因,對照樣本)
K=A-B
表達倍數=2-K