BNP同ANP均是腎素血管緊張素-醛固酮系統（RAAS）的天然拮抗劑，亦抵制后葉加壓素及交感神經的保鈉保水、升高血壓作用。
BNP同ANP一起參與了血壓、血容量以及水鹽平衡的調節，提高腎小球濾過率，利鈉利尿，擴張血管，降低體循環血管阻力及血漿容量，這些均起到維護心功能作用。
BNP又不同于ANP，ANP主要在心房合成，在心房負荷過重或擴張時分泌增加，血漿濃度升高，主要反映肺血管壓力的變化，其他一些激素如抗利尿激素、兒茶酚胺類物質可直接刺激ANP分泌，因ANP前體儲存于分泌顆粒中，分泌時分解為ANP，其快速調節主要在激素分泌量多少上進行；
而BNP主要在心室合成，在心室負荷過重或擴張時增加；因此反映心室功能改變更敏感、更具特異性，因BNP前體并不儲存于分泌顆粒，BNP的合成與分泌的快速調節在基因表達水平上進行。