有許多毒素可以通過阻止肌動蛋白聚合（latrunculin和細胞松弛素D）或通過穩定它（鬼筆環肽）來干擾肌動蛋白的動力學：
Latrunculin是一種由海綿產生的毒素，它與G-肌動蛋白結合，阻止它與微絲結合。
細胞色素D是由真菌產生的生物堿，其與F-肌動蛋白的（+）末端結合，阻止添加新單體。已發現Cytocalasin D可破壞肌動蛋白的動態，激活動物體內的蛋白質p53。
鬼筆環肽（Phalloidin）是一種從死亡蘑菇傘形毒蕈（Amanita phalloides）中分離出來的毒素。它與F-肌動蛋白聚合物中相鄰肌動蛋白單體之間的界面結合，阻止其解聚。