某些細菌能將進入菌體的藥物泵出體外，這種泵因需能量，故稱主動流出系統（active efflux system）。由于這種主動流出系統的存在及它對抗菌藥物選擇性的特點，使大腸埃希菌、金黃色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、銅綠假單胞菌、空腸彎曲桿菌對四環素、氟喹諾酮類、大環內酯類、氯霉素、β-內酰胺類產生多重耐藥。細菌的流出系統由蛋白質組成，主要為膜蛋白。這些蛋白質來源于4個家族：①ABC家族（ATP-binding cassettes transporters）；②MF家族（major facilitator superfamily）；③RND家族（resistance-nodulation-division family）；④SMR家族（staphylococcal mulitdrug resistance family）。流出系統有三個蛋白組成，即轉運子（efflux transporter）、附加蛋白（accessory protein）和外膜蛋白（outer membrane channel ），三者缺一不可，又稱三聯外排系統。外膜蛋白類似于通道蛋白，位于外膜（G-菌）或細胞壁（G+菌），是藥物被泵出細胞的外膜通道。附加蛋白位于轉運子與外膜蛋白之間，起橋梁作用，轉運子位于胞漿膜，它起著泵的作用。