和傳統抗體相比，納米抗體并非僅以小取勝，它有著多方面的優勢：
（1） 體積較小，僅為普通抗體的十分之一。因為體積小，它在動物組織體內的穿透力更強，比如，它可以通過人體的腦組織，可以達到高密度的腫瘤內部，這些都是普通抗體做不到的。納米抗體的小體積優勢，讓人們可以通過它來治療某些腫瘤或腦部疾病。
（2） 效能穩定。納米抗體在體內不被自然分解的時間比普通抗體長，這意味著藥效時間更持久。而且它適應的溫度范圍較廣，在高達90°C的溫度下仍能發揮作用，而傳統的抗體在這樣的狀態下則會失活。即使是在極端pH值下它的表現也十分穩定，甚至能從人胃中通過而保持有效性。
（3） 抗原特異性好，且易于基因改造。納米抗體能夠識別獨特的抗原構造表位，比普通抗體具有更廣泛的抗原結合能力，并且方便人工改造以獲得對抗不同病原的抗體。納米抗體能夠很容易在微生物中進行合成，能在噬菌體、大腸桿菌、酵母等微生物中大量表達，易于大規模生產。