試劑、試劑盒 甲酰胺核酸寡核苷酸
儀器、耗材 ABI PRISM 3100Genetic Analyzer微量離心管DTR Gel Filtration Cartridges (Edge Biosystems)或相應的真空濃縮儀
實驗步驟
一、材料
1.緩沖液和溶液
樣品上樣液
所用的樣品上樣液取決于所用的設備。對于ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer,推薦使用高度脫離子
的甲酰胺(如ABI的Hi-Di-甲酰胺)。
2.核酸和寡核苷酸
在方案3中二、方法、步驟5得到的測序反應產物
3.特殊設備
ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer,微量離心管,DTR Gel Filtration Cartridges(Edge Biosystems)或相應的真空濃縮儀
二、方法
1.從包裝袋中取出所需數目的組裝好的圓筒,仔細檢査,確保圓筒中板模沒有干,如果管中已經沒有多余的液體或是板模已干,加入200ul去離子水,使板模重新水合幾分鐘。
2.將圓筒放于微董離心管中,1360g離心2min(如在采用固定傾角轉子的Eppendorf5415C中4000r/min)。這一步是必需的,否則圓簡中會加入多余水分.
3.取出圓筒,放置到另一個干凈的管中,小心將樣品加入到板模的中間。
4.將圓筒放回到離心機,保持與第一次離心相同的方向,1360g離心1~1.5min。
較短的離心時間則回收率較低,一般為75%~85%,但幾乎可以完全去除沒有結合的染料.較長的離心時間雖然可提高回收率(95%),但是洗脫物中會混有終止染料,導致引物附近的堿基含混不清。
5.洗脫物可在-20°C凍存,也可以用自動測序儀立即分析。
6.在其空濃縮儀中濃縮洗脫物20~30min,不要加熱,由于染料是光敏感的,濃縮時間不宜過長,否則可能導致降解。
7.按照測序儀的說明書,用10ul的上樣緩沖液重懸樣品,上樣董取決于所使用的測序儀,對于ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer而言,每個毛細管加1~l.5ul即可。
8.按照測序儀說明書進行電泳分離和樣品分析。