磁性液位計在運轉中引起的問題剖析可分為：調試期問題，運轉期問題，管道系統和裝置等方面引起的，環境方面引起的，流水方面引起的等。
常見磁性液位計調試期問題主要有裝置不妥、環境干擾、流體特性影響：
1、環境方面
主要是管道雜散電流干擾，空間電磁波干擾，大電機磁場干擾等。
磁性液位計管道雜散電流干擾通常采取良好單獨接地維護可取得稱心丈量，但如遇管道有強雜散電流(如電解車間管道)亦不一定能克制，須采取流量傳感器與管道緣絕的措施。
空間電磁波干擾-般經信號電纜引入，通常采用單層或多層屏蔽予以維護，但也曾遇到屏蔽維護還不能克制。
2、管道系統和裝置等方面
通常是磁性液位計電磁流量傳感器裝置位置不正確引起的問題，常見的例如將流量傳感器裝置在易積聚潴留氣體的管網高點；
流量傳感器后無背壓，液體逕直排人大氣，構成其丈量管內非滿管；裝在自上向下流的垂直管道上，可能呈現排空等。
3、流體方面
液體含有平均散布細小氣泡通常不影響正常丈量，磁性液位計所測得體積流量是液體和氣體兩者之和；
氣泡增大會使輸出信號動搖，若氣泡大到流過電極遮蓋整個電極外表，使電極信號回路瞬時斷開，輸出信號將產生更大動搖。
4、內壁附著層
由于磁性液位計丈量含有懸浮固相或污臟體的時機遠比其他流量儀表多，呈現內壁附著層產生的問題概率也就相對較高。因而運用單位要認識設置控制室儀表電源線防雷設備的重要性。