主要檢測糞便中腺病毒。普通電鏡觀察即能明確腺病毒存在,用免疫電鏡可分型。糞便原液用血凝抑制試驗或ELISA可測得腺病毒抗原。應用聚丙烯酰胺凝膠電泳法亦可測得糞便中腺病毒,陽性率高于電鏡。
由于腸腺病毒不能進行常規細胞培養,因此采用DNA限制性內切酶檢測法以測定腺病毒的特異基因,但方法復雜,且需多量病毒存在,故雖特異性強,但難以開展。