臨床表現為胸痛，可有肩背部放射痛，干咳偶有少量黏痰或膿痰。肺膿腫時，咳痰為典型的巧克力色，并有高熱、盜汗、食欲不振等全身中毒癥狀。阿米巴肝膿腫破入肺及支氣管后，可突然咳出大量巧克力色膿痰，伴劇烈胸痛和呼吸困難，偶有胸膜休克，最終形成肝膈胸膜腔瘺。也可穿破皮膚形成肝、膈皮膚瘺，外排黏稠巧克力色膿液，經久不愈。體格檢查可見右側肺部實變、呼吸音減弱、濕啰音或胸腔積液，合并肝膿腫可有肝大，壓痛，50%合并杵狀指。
