臨床上測定ALP主要用于骨骼、肝膽系統疾病的診斷和鑒別診斷，尤其是黃疸的鑒別診斷。對于不明原因的高ALP血清水平，可測定同工酶以協助明確其器官來源。
1.生理性增高
兒童在生理性的骨骼發育期，堿性磷酸酶活力可比正常人高1～2倍。處于生長期的青少年，以及孕婦和進食脂肪含量高的食物后均可以升高。
2.病理性升高
（1）骨骼疾病如佝僂病、軟骨病、骨惡性腫瘤、惡性腫瘤骨轉移等；
（2）肝膽疾病如肝外膽道阻塞、肝癌、肝硬化、毛細膽管性肝炎等；
（3）其他疾病如甲狀旁腺機能亢進。
3.病理性降低
見于重癥慢性腎炎、兒童甲狀腺機能不全、貧血等。