就目前而言，對于乙肝腎炎尚未無特效的治療方法。免疫抑制劑雖然對多種類型腎小球腎炎有益，但可能延緩縮主清除乙型肝炎病毒的能力，因此多數人不主張激素治療。干擾素有抗病毒作用，通過與細胞表面受體異性結合，激活某些酶以后阻斷病毒的繁殖與復制，但不能進入宿主細胞直接殺滅病毒。阿糖腺苷能抑制DNA多聚酶和核苷酸還原酶，從而抑制病毒的復制，如果聯合應用干擾素治療，可獲得更好的效果。此外，清熱利濕、活血化瘀、益氣健脾的中藥對調節機體免疫功能，抑制和殺滅乙型肝炎病毒，也有一定的療效。
乙肝腎炎患者如在乙型肝炎活動期應該隔離，患者應增強自信心，克服焦躁憂傷情緒，讓身體慢慢增強抵抗力，去戰勝疾病。