篩分型瓊脂糖凝膠的鋪膠和電泳與普通瓊脂糖凝膠一樣，但它們能與非變性聚丙烯酰胺凝膠一樣分辨小片段DNA。
DNA
TAE瓊脂糖
電泳儀
1. 在TAE電泳緩沖液中熔化3%~5%低熔點篩分型瓊脂糖。將膠倒入普通瓊脂糖凝膠裝置中。2. 與普通瓊脂糖凝膠一樣加樣和電泳。（對2%的凝膠溴酚藍遷移到大約50 bp）
3. 分離低熔點瓊脂糖中片段。（對于＜1 000 bp 的片段回收的產量與用普通的低熔點瓊脂糖相似，對于＜500 bp 的片段分離度可達到最高）
