• <option id="immmk"></option>
  • <noscript id="immmk"><kbd id="immmk"></kbd></noscript>
    發布時間:2016-01-13 11:16 原文鏈接: 科學家開發新的人類基因組組裝方法

      最近,美國楊百翰大學的研究人員,開發出了一種新的人類基因組組裝方法,并無意中發現了一種新的方法,可識別幾種常見遺傳病中難以捉摸的標記。

      這種新方法依賴于研究人員開發的一種新算法,這種方法對于DNA序列中特定類型的變異,更為敏感。

      本文第一作者、計算機科學博士Paul Bodily指出:“這需要堅持不懈,結果并不是我原本打算調查的。我只是繼續沿著一條路,不知道它將要去哪里,直到我發現有閃亮的東西出現。”

      每個人在其每個細胞中都有各自基因組的2個拷貝,每個拷貝都來自親本一方。兩個拷貝的序列是相同的,但有時也有一段序列被反轉,稱為倒位(inversion)。

      倒位往往是有生物學意義的。以前的研究已經表明,倒位和精神發育遲滯、糖尿病、癲癇,精神分裂癥和自閉癥之間存在一種關聯。

      該研究結果發表在國際生物信息學權威雜志《Bioinformatics》上,詳細介紹了這種新算法的性能如何優于其他方法,并意外發現了這種新算法檢測倒位的能力。

      此前,檢測倒位是非常困難的,但是研究人員認為,他們的方法可以顯著提高這一檢測過程。

      本文資深作者、計算機科學教授Mark Clement指出:“有些疾病,如自閉癥,我們真的不確定是什么原因造成的。至少有改進的工具用于檢測可能的原因,是很重要的。”

      該研究小組讓這種新算法源,可以自由提供給任何其他想要應用它的研究人員。Bodily離畢業還有幾年,但他預期將在一個更大的范圍內,應用這一新的模塊。

      Bodily說:“如果你制定正確的數據,你可以產生幾乎所有看上去很好的算法,但是我們的算法是基于一些非常基本的理論。理論和實踐往往不是一致的,但我非常希望,當我們的方法適用到更大的前景時,將很好的發揮作用。”

    相關文章

    因美納推出5堿基解決方案以驅動多組學發現,開啟基因組與表觀基因組的同步洞察

    ? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。? 因美納專有的5堿基化學技術......

    許瑞明研究組合作揭示人逆轉座子LINE1靶向整合基因組的重要機制

    人類基因組中存在大量具有"跳躍"能力的逆轉座子(retrotransposon)序列。在胚胎發育早期、免疫和神經系統等特定階段和環境下,它們會被激活,發揮重要生理功能;在病毒感染、......

    高精度完整基因組助橡膠育種駛入“快車道”

    橡膠樹是天然橡膠的主要來源。“橡膠樹育種面臨的主要困難在于周期長和效率低,通過常規育種方法將多抗、高產性狀聚合往往需要30~40年。”中國熱帶農業科學院橡膠研究所研究員程漢告訴《中國科學報》。然而,目......

    小麥野生近緣種基因組“密碼”被破解

    記者宋喜群、馮帆從山東農業大學獲悉,該校農學院教授孔令讓研究團隊首次組裝了小麥遠緣雜交常用物種中間偃麥草和鵝觀草染色體水平的高質量基因組序列,解析了二者基因組結構差異與獨立多倍化演化路徑,對兩者攜帶的......

    煙草分枝發育的“開關基因”被發現

    近日,中國農業科學院煙草研究所煙草功能基因組創新團隊發現煙草分枝發育“開關基因”,預示著未來作物株型調控有了新靶點。相關研究成果發表在《植物生物技術》(PlantBiotechnologyJourna......

    新研究破譯薇甘菊入侵基因密碼

    薇甘菊作為全球十大最具危害的惡性入侵雜草之一,以其驚人的繁殖速度和強大的環境適應性,在亞洲、太平洋地區及中國華南地區造成嚴重生態破壞。然而,其基因組層面的適應性進化機制長期未被系統解析,制約了科學防控......

    研究開發出酵母泛基因組數字模型與代謝網絡分析方法

    近日,中國科學院大連化學物理研究所研究員周雍進團隊與上海交通大學副教授魯洪中合作,在酵母系統生物學研究中取得新進展。研究團隊通過整合分析全球1807株釀酒酵母菌株的基因組與生態位數據,構建了高覆蓋度的......

    基因組大數據還原野豬橫跨歐亞的百萬年遷徙歷程

    近日,中國農業科學院農業基因組研究所農業基因編輯技術創新團隊深入解析了中亞野豬種群在跨越歐亞大陸百萬年的遷徙歷程中適應環境的獨特遺傳密碼,為理解大型哺乳動物如何應對環境變化提供了全新視角。相關研究成果......

    基因組密碼被解鎖:深度學習模型破解非編碼區奧秘

    人類基因組中超98%的遺傳變異位于非編碼區,這些變異通過調控染色質可及性、三維構象、剪接加工等多種分子機制影響基因表達,最終導致疾病發生。由于調控機制的復雜性和細胞類型特異性,目前解讀非編碼變異的分子......

    “女媧”基因組計劃發布第八項成果

    近日,中國科學院生物物理研究所徐濤研究組和何順民研究組在《基因組、蛋白質組與生物信息學報》雜志發表論文。兩位科學家牽頭的“女媧”中國人群基因組計劃旨在構建中國人群的全基因組數據資源,支撐中國人群的疾病......

  • <option id="immmk"></option>
  • <noscript id="immmk"><kbd id="immmk"></kbd></noscript>
    伊人久久大香线蕉综合影院首页