分析測試百科訊 來自密歇根大學綜合癌癥中心和賽默飛世爾科技的研究人員已經開發并測試了一種新的工具,可以對由遺傳性異常引發的常見癌癥進行搜索。試驗表明基因測序在一個大體積樣品里能發揮更好的能力。
“密歇根大學在應用測序領域有豐富的經驗。做分析是我們面臨的一個主要挑戰和一大瓶頸。我們的目標是找到一種方法,使這一過程能夠擴展到更大的規模和容量中去。” 密歇根大學醫學院病理學和泌尿學助理教授Scott A. Tomlins博士說。
Tomlins是發表腫瘤描述新方法論文的資深作者,論文里的方法叫做Oncomine綜合分析法,研究只通過賽默飛世爾科技開發測試。
研究人員通過對超過700000個腫瘤樣本數據庫進行篩選并確定在癌癥類型中最常見的遺傳變異體。然后,他們過濾FDA批準的藥物相關聯的變體、在臨床指南中被引用的變體以及臨床研究治療有關的變體的列表數據。
研究人員評估了300多個組織樣本,其中包括超過100個常規臨床檢驗基因。該試驗證實了以前確定的基因變化,同時還確定了組織樣本中的其他相關變異。
新的測序方法比目前的測序平臺完成速度更快,價格更便宜。它也可以用于大范圍腫瘤類型的樣品,包括小活檢及存檔的組織樣本。在未來,這可能意味著患者不需要總是接受新鮮活檢才能確定潛在的治療策略。
“個性化醫療的真正挑戰是,我們要為每一個病人找到真正可操作的目標。但我們現在的發現是并非總是如此,特別是當我們看到沒有多線標準治療的患者樣本時”Tomlins說。“個性化醫療的未來將意味著知道在早期有什么遺傳變異推動一個病人的腫瘤,然后我們就可以把它放在最佳治療路徑里盡快解決。
“這項研究的結果表明,我們現在可以幫助臨床研究人員克服挑戰,使他們不必擔心新一代測序的確定和相關基因變異的常規使用。” 研究的共同作者,賽默飛世爾科技腫瘤戰略副總裁Dan Rhodes博士說。“我們現在已經可以申請一個高度可擴展并有針對性的癌癥變種測序方法,不久的將來它會在臨床常規應用中打開一扇新的大門。”
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