電泳槽清洗部件：
電泳槽部件組裝前要徹底清洗干凈。尤其是玻璃板及凹形帶槽橡膠框，必須用泡沫海綿沾少許肥皂粉或洗滌劑徹底清洗干凈。清洗后的玻璃板應放在玻璃板支架上晾干水后方能使用。
A組裝電泳槽
1、將四只固定螺桿插進一只貯液框(半上槽)的相應孔洞中，然后將貯液框仰放在桌上。
左手拿凹型槽橡膠模框，右手的拇指與中指握住玻璃板的兩側邊緣插到橡膠模框內 (注意手指不能接觸灌膠面的玻璃板)。
將帶有玻璃的橡膠模框子放在仰放的貯液槽框架上，其下緣必須對齊貯液槽框下緣。
雙手拿另一只貯液槽框與仰放在桌上的貯液槽框相合，并使橡膠框上的凸出線位于貯液槽有機玻璃框中央。
裝上四只螺母，擰緊螺絲。注意擰緊螺絲時用力應均勻，用雙手按斜角位置雙雙逐漸擰緊。
將電泳槽垂直豎起，放在桌上，帶短玻璃板的貯液槽稱上槽(陰)，帶長玻璃板的貯液槽稱為下槽(陽)，在長玻璃板與橡膠框間有一縫隙。此縫隙可用已熔化的10％瓊脂沿長玻璃板下端灌入，為防止留存氣泡，可稍抬起一端即可趕去氣泡。待瓊脂完全凝固后才能灌膠。
也可將槽垂直豎起，將帶有玻璃的橡膠模框直接放入槽中，對稱擰緊螺絲后，用瓊脂封底邊。
B灌膠
先灌分離膠，待凝固后再灌濃縮膠。灌膠前接通冷卻水，夾緊連接上下貯液槽的兩根橡膠管。
用細頭滴管吸取膠液，沿長、短玻璃板中間縫隙從一端加入膠液。為防止產生氣泡，可稍拾起另一端(氣泡往高處走)，不斷加入膠液。若單層膠(分離膠)則加膠量約距離短玻璃板上端0.3厘米處，輕輕加少許水，雙手輕輕將梳子插入，待膠凝后就可形成凹形加樣孔。
為防止漏膠，在上、下貯液槽中立即加入蒸餾水，但蒸餾水不能*過短玻璃板上緣。
膠凝固后即可看到樣品槽梳子與凝膠板間有一層折射率不同的亮區。