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    發布時間:2019-04-10 19:32 原文鏈接: 用于基因芯片分析的血液樣品的準備

    用于基因芯片分析的血液樣品的準備可用于:(1)基因表達分析;(2)分析血液中白細胞的基因表達情況。

    實驗方法原理基因芯片(genechip)(又稱DNA芯片、 生物芯片)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的測序原理是 雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的靶 核苷酸的探針。當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應位置的核酸探針產生互補匹配時,通過確定熒光強度最強的探針位置,獲得一組序列完全互補的探針序列。據此可重組出靶核酸的序列。 
    實驗材料

    血液樣品

    試劑、試劑盒

    淋巴細胞分離液滅菌生理鹽水Trizol

    儀器、耗材

    離心機

    實驗步驟

    1、將2 mL抗凝血(肝素或者EDTA鹽抗凝都可),以3,500 轉/分,離心10分鐘。將會看到血液分為2層,上層是淡黃色的血漿,約占60%,


    2、用巴士滴管或吸管將上層血漿吸出,還剩約1ml血細胞層,在血細胞層中加入1:1體積,即約1ml的滅菌生理鹽水,混勻。


    3、以下是把12ml生理鹽水與血細胞混合物(相當于12ml全血)合并成一管后分離白細胞過程。將24 mL淋巴細胞分離液(是全血體積的2倍)預先加入滅菌的50 mL 離心管中。將與生理鹽水混合的血細胞緩慢加入淋巴細胞分離液液面上,注意盡量不要讓血細胞層摻入到淋巴細胞分離液層去,此過程可見圖3;然后以1500轉/分,離心20 分鐘(離心機要求水平轉頭)。可以看到液體分為三層,上層是淡黃色的血漿,中間一層乳白色,最下面一層是紅色的血細胞。在中間層和上層交界處是有一層白色的膜,即白細胞層,同時在明顯的白細胞層下面有較厚的乳白層液體,此層液體中也含有白細胞,但量較少,若血液足夠,可以考慮不要此層(若白細胞層不很明顯而乳白色液體層太厚,可以2500轉/分,繼續離心10 分鐘以加強白細胞的分離效果)


    4、用巴士滴管或移液器收集界面上的白細胞層,放入滅菌的1.5 mL EP離心管中,以 10,000 轉/分,離心5 分鐘,吸掉上清。可見白色的沉淀,有時白色的沉淀上還混有紅色的血細胞(少量紅細胞無妨).


    5、去上清液,在細胞沉淀中,加入1ml Trizol試劑,用移液器充分抽打,混勻,直到形成清亮不粘稠度的液體(表明細胞被充分溶解,基因組DNA被充分打斷)


    6、后續可以按照Trizol試劑的標準操作抽提總RNA。也可以把此Trizol試劑保存在生物冰(低于15℃即可)郵寄給我們,由我們來完成后續的抽提過程。一般每5 ml全血可以得到10-15ug總RNA。


    展開 
    注意事項

    1、 淋巴細胞分離液一般要求保存在4℃中。淋巴細胞分離液從冰箱取出后,不要馬上應用,以避免對細胞冷的刺激,引起基因表達的改變。需待溶液溫度升至室溫時,混勻后使用。


    2、整個分離過程中,溫度應在18-28℃;溫度過高與過低均影響分離質量。

    其他

    1. 在一些方法中,是在全血中直接加淋巴細胞分離液后離心分離紅細胞;這樣得到的白細胞沉淀中帶有較多的血漿蛋白,影響RNA的抽提,因此我們建議用以上方法,先把血漿棄去后再加淋巴分離液。


    2. 在一些方法中,分離得到的白細胞先用RNAlater保存進行運輸;由于分離的白細胞往往污染有紅細胞,紅細胞會影響 RNAlater的保存效果;另外,保存在RNAlater中的白細胞在重新回收提取RNA時還有部分損失。


    因此若實驗室有Trizol試劑,我們建議直接用Trizol試劑把白細胞溶解,在Trizol試劑中的RNA是相對穩定的,-20℃可以保存一個星期,-70℃可以保存一個月。


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