土地用途改變
土地用途改變是20世紀70年代以來陸地和淡水生態系統退化的最大直接驅動因素。主要包括開墾、基礎設施建設、城市擴張、采礦、道路擴建、水電大壩以及管線建設等。這些活動造成毀林、生境破碎化等，進而導致生物多樣性喪失。海洋和沿海土地利用變化包括沿海擠占生境、近海水產養殖、海水養殖、底拖網捕撈、陸上開荒、沿海城市擴張等。
生物資源過度利用
生物資源過度利用是一些物種成為珍稀瀕危物種甚至滅絕或資源物種減少的重要原因。其中，盜獵和貿易直接將很多野生動物推向滅絕的邊緣。過去50年中，魚類和海產品過度利用為海洋生物多樣性喪失的最大驅動因素。
氣候變化
氣候變化對物種的分布、物候、種群動態以及物種組合或生態系統結構和功能已經產生了明顯影響，而且正在變得越來越嚴重。47%的受威脅哺乳動物和23%的受威脅鳥類可能已經受到氣候變化的影響，許多無法適應快速氣候變化的物種，則面臨著更大的威脅。因臭氧損耗而增加的紫外線也對農、林、牧、漁相關的生物多樣性造成嚴重的威脅。