瓊脂糖凝膠電泳的優點
對于大多數應用，僅需要單組分瓊脂糖，不需要聚合催化劑。因此，瓊脂糖凝膠制備簡單，快速。
凝膠易于倒入，不會使樣品變性。
樣品也可以回收。
瓊脂糖凝膠電泳的缺點
凝膠在電泳過程中會融化。
緩沖區可能耗盡。
不同形式的遺傳物質可能以不可預測的形式運行。
