X獎基金會近日決定取消了獎金高達1000萬美元的基因組學Archon X獎(Archon Genomics X Prize),因為基因組測序成本的直線下降已使得競爭毫無意義。
X獎基金會的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了關閉競賽的決定。他表示,這是因為如今每個基因組的測序費用不到5,000美元,并能在幾天內完成。“我們認為競賽不能激勵技術改變,而這一目標正是我們的主席Craig Venter博士、我們的贊助商Stewart and Marilyn Blusson以及X獎委員會的初衷。基于這一理由,我們決定有史以來第一次取消X獎。”
基因組學X獎致力于推動測序技術改進
基因組學X獎于2006年啟動,旨在刺激測序創新,其目標是在10天內對100個人類基因組進行測序,每個基因組的費用控制在1萬美元以下。之后,目標調整為對100個百歲老人進行測序,以便創建出醫療級別的基因組。參賽隊伍被要求在30天內完成測序,且每個基因組的測序費用控制在1,000美元或以下。此外,還有準確性和完整性方面的要求。
參賽隊伍的正式招募從2011年11月開始。去年7月,Life Technologies成為第一支正式報名參賽的隊伍。三個月后,哈佛大學Wyss研究所George Church 領導的隊伍加入。然而,到今年5月31日報名截止時,也仍然只有這兩支隊伍。不過,發言人表示,取消競賽的決定與參賽人數無關。
《Nature》的記者Erika Check Hayden曾表示,要想贏得這1000萬美元可沒那么簡單。目前主流的測序技術是對DNA短片段測序,再進行拼接,會引入錯誤,難以達到X獎對錯誤率的要求。而對長片段測序的新技術比較慢,也很昂貴。
Diamandis表示,盡管已取消,但這次競賽讓人們看到了快速、低成本的醫療級別基因組的需求。此外,它也帶來了一些重要的資產。100位百歲老人的血液樣本被采集,且細胞系已建立,以保存他們的DNA。
同時,在鄧普頓基金會(Templeton Foundation)的支持下,驗證步驟已建立。Diamandis認為這是行業第一個分析工具,可評估全基因組序列的整體質量。“兩者都有巨大的潛力,將使全世界的基因組學研究界受益。”
與此同時,基因組學X獎的高級主管Grant Campany不排除有另一個X獎,也是關于基因組學方面的競賽。“我們正在與冠名贊助商討論其他可能的獎項贊助機會。”
多數公司為何不愿參加基因組學Archon X獎?
一個解釋是參賽投入比獎金花費還大,但是之前的的Ansari X獎花費的成本也不小,卻能吸引好幾十個參賽者。
一部分答案是,一個基因組學的獎項不容易向大眾解釋,結果它不具有相同的宣傳效益。美國加州大學圣巴巴拉分校納米技術協會中心的研究員Luciano Kay解釋道。Kay接著說,一場可以行駛10公里的無人駕駛汽車競賽遠比在微小尺度上對一個物質或基因進行操作以解決一個科學技術性難題更具吸引力。
并且,基因組學X獎的目標——快速和廉價地在醫療級別測定全基因組序列——目前也許并不是商業市場上的當務之急。基因組學已經蓬勃發展到以不完整序列為研究基礎,Rothberg指出,目前科學家只能解讀一小部分編碼蛋白質的基因組(外顯子),他們還不清楚能從其余精確序列中得到什么。
盡管如此,誰贏得了這個大獎就有自豪資格了,這就解釋了為什么Ion Torrent決定參賽,也解釋了為什么Illumina決定不參賽:失敗只會削弱他們的聲譽。休斯醫學研究所Janelia農場校園開發應用科學工具的Timothy Harris說道。
基因組學X獎高級主管Grant Campany希望還有其他團隊在9月份比賽開始前加緊參與競爭。即使他們不來,科學家預計這些目標在未來幾年內也將會實現,無論是通過獎項還是不通過獎項。“如果你能夠有那樣的表現,那么你的商業優勢將大大超過其他任何人。” Harris說。“這種商業優勢比X獎本身更有價值。”
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