多重耐藥菌(multiple resistant bacteria)是指有多重耐藥性的病原菌。Multiresistance可以翻譯成多藥耐藥性、多重耐藥性，其定義為一種微生物對三類（比如氨基糖苷類、紅霉素、B－內酰胺類）或三類以上抗生素同時耐藥，而不是同一類三種。
泛耐藥菌(pan resistant bacteria) 是指對除黏菌素外的所有臨床上可獲得抗生素均耐藥的非發酵菌, 對幾乎所有類抗菌素耐藥。比如泛耐不動桿菌，對氨基糖苷、青霉素、頭孢菌素、碳氫酶系 、四環素類、氟奎諾酮及磺胺類等耐藥。
多重耐藥性(multiple resistance, MDR) 系指同時對多種常用抗微生物藥物發生的耐藥性, 主要機制是外排膜泵基因突變, 其次是外膜滲透性的改變和產生超廣譜酶。
最多見的是革蘭陽性菌的MDR-TB和MDR-MRSA, 以及常在ICU中出現的鮑曼不動桿菌和銅綠假單胞菌,僅對青霉烯類敏感； 嗜麥芽窄食單胞菌幾乎對復方新諾明以外的全部抗菌藥耐藥。MDR的出現決定了聯合用藥的必然； MDR菌株的高頻率出現, 意味著抗微生物藥物時代即將結束。
微生物耐藥率不斷增加的原因主要是：不合理使用和濫用，如美國用于人類抗感染與農牧業應用各占50%，其中用于院內抗感染僅占20%，而社區卻占了80%，濫用率為20%~50%；在農牧業中治療性應用僅占20%，而預防和促生長應用卻占了80%，濫用率為40%~80%，每年有4萬死亡病例是由耐藥菌所致。
我國的濫用現象較美國更為嚴重，WHO對我國濫用抗菌藥的評估是：中國97%的病毒性支氣管感染患者使用了抗菌藥；在初級醫療保健體系中30%~60%患者使用了抗菌藥。
多重耐藥菌的定義來源于美國CDC2006年發布的指南“Management of Multidrug-Resistant Organisms In Healthcare Settings, 2006 ”，其英文原為如下：
MDRO definition. For epidemiologic purposes, MDROs are defined as microorganisms, predominantly bacteria, that are resistant to one or more classes of antimicrobial agents (1).Although the names of certain MDROs describe resistance to only one agent (e.g., MRSA, VRE), these pathogens are frequently resistant to most available antimicrobial agents . 或者其附錄中的解釋：
Multidrug-resistant organisms (MDROs). In general, bacteria (excluding M. tuberculosis) that are resistant to one or more classes of antimicrobial agents and usually are resistant to all but one or two commercially available antimicrobial agents (e.g., MRSA, VRE, extended spectrum beta-lactamase [ESBL]-producing or intrinsically resistant gram-negative bacilli).