對于大多數膽管良性狹窄的病例，膽管-空腸吻合術是較好的膽道重建術式。但由于缺乏大宗病例的長期隨訪結果，這種修復技術的確切治療價值尚待進一步評估，需嚴格掌握其手術適應證。
對于難以重建的肝段或肝葉膽管損傷以及繼發區段性肝壞死、肝膿腫或肝管結石病例，可將病變膽管與受累區段肝臟一并切除。對于復雜膽管損傷后繼發膽汁性肝硬化造成終末期膽病的患者，肝移植可能是惟一有效的手段。
內鏡和介入技術在醫源性膽管損傷診治中的應用逐漸增多，但是對于損傷性膽管狹窄或手術后膽腸吻合口狹窄采用狹窄段膽管球囊擴張或支架支撐并不能獲得滿意的長期療效。只有少數沒有組織缺損的輕微膽管損傷，內鏡下十二指腸乳頭切開和放置支架可以作為其確定性治療方法。內鏡和介入技術在損傷性膽管狹窄治療中最重要的價值是作為輔助性治療手段用于確定性手術前控制膽漏和感染以及手術后復發性膽管狹窄的處理。