1.熊去氧膽酸
熊去氧膽酸可使膽汁淤積癥的血清標記物得到改善，3個月內可使血清膽紅素明顯下降，血清堿性磷酸酶、轉氨酶、膽固醇及IgM均明顯下降。
2.D-青霉胺
能降低肝內銅水平，抑制炎性反應，減輕纖維化，延長患者生存期。嚴重不良反應有皮疹、蛋白尿、血小板或粒細胞減少，應每周查尿蛋白，4周后每月查1次，觀察白細胞計數變化，必要時需中止治療。
3.免疫抑制藥
①環孢素A，作用明顯，但因有肝腎毒性不宜久用，治療8周后血清堿性磷酸酶明顯下降。②氨甲蝶呤，早期小劑量應用可改善組織學變化。③硫唑嘌呤，可改善膽管的排泄，似對皮膚瘙癢有效，但副作用較大，且不能阻止肝細胞功能衰竭。
4.對癥治療
（1）瘙癢 可用抗組胺藥物，如非那根、撲爾敏、苯海拉明等。消膽胺，劑量從小量開始，以能控制瘙癢為度。氫氧化鋁能與膽汁酸結合，對肝性瘙癢有效。
（2）骨質疏松及骨化 可采用維生素D肌內注射。葡萄糖酸鈣稀釋到葡萄糖液中靜脈滴注。
（3）夜盲癥 維生素A。血清鋅低于正常可口服硫酸鋅連服4周，至暗適應恢復正常。
（4）凝血機制障礙者 可使用維生素K1。
（5）肝移植 原發性膽汁性肝硬化終末期患者為肝移植對象。
（6）飲食 低脂肪（每日50g以下）、高糖、高蛋白飲食，多食蔬菜。