1.飲食療法
應強調繼續飲食，滿足生理需要，補充疾病消耗，但應根據個體進行合理調整。母乳喂養者繼續母乳喂養，人工喂養兒可喂米湯或稀釋的牛奶或其他代乳品。嚴重嘔吐者可暫時禁食4～6小時（不禁水），待好轉后繼續喂食。腹瀉停止后繼續給予營養豐富的飲食。
2.糾正水、電解質、酸堿平衡紊亂
輕中度脫水，無嚴重嘔吐者可口服世界衛生組織推薦的口服補液鹽（ORS）。新生兒，或有明顯嘔吐、腹脹、休克、心腎功能不全或其他嚴重并發癥患兒不宜采用口服補液鹽。
3.藥物治療
病毒以及非侵襲性細菌所致腸炎可不使用抗生素。中毒癥狀明顯，特別是新生兒、嬰幼兒、重癥患兒可使用抗生素。對于病毒感染所致的腸炎，抗生素并無效果。寄生蟲感染所致腸炎需使用抗寄生蟲藥物。可酌情選用胃腸道黏膜保護劑及微生態療法。