沙眼衣原體核酸檢測是目前檢查是否感染沙眼衣原體的最常用的檢查手段，可以提取黏膜表面的分泌物進行檢測，準確性比較高。沙眼衣原體容易感染人體的黏膜組織，例如引起結膜炎、泌尿系統感染等，及時確診后采取針對性的抗感染治療，是取得良好治療效果的關鍵。但傳統檢測方法中對衣原體抗體進行檢測通常準確性比較低，而進行衣原體培養，雖然準確率很高，但需要耗費很長時間，并且花費很高。隨著技術的進步，目前可以對衣原體內部的遺傳物質，也就是DNA進行特異性的檢測，具有非常高的準確性，并且檢測時間很短，花費也不高，是目前最理想的檢測手段。