水質在線監測系統能夠盡可能早的發現水質的異常變化，并做出預警預報，這就能有效避免下游水質遭受污染，此外，它還能夠對污染源進行及時追蹤，從而為管理決策提供相關的服務。水質在線監測系統主要是由四個部門組成即監控中心、采集和傳輸數據的單元、分析測試單元、采樣單元等。當前使用的比較頻繁的在線監測系統主要包括UV、五參數、TP、TN、TOC、NH3-N、COD等。
首先是水質在線監測系統監控中心。監控中心能夠發揮的主要作用就是對各種污染源的監測數據進行接收、匯總以及統計等。其次是采集和傳輸數據的單元。采集和傳輸數據的這種單元一般采用的是單片機、工控機或者是可編程控制器的方式，不管是哪種方式，通訊協議都是全國統一的，這有助于便于儀器連接通訊。在傳輸數據的時候可以使用無線電臺、局域網、GSM、GPRS、電話線等多樣化的方式。最后是采樣單元。目前采樣的主要方式是潛水泵或者是自吸泵。
根據不同的原理，可以把線監測儀器使用的方法分為電導法、紫外催化氧化—紅外吸收法以及燃燒氧化—紅外吸收法等。其次是NH3-N在線監測儀器。這種儀器的使用方法主要包括電導法、氨氣敏電極法、銨離子選擇電極法、比色法、滴定法等。最后是COD在線監測儀器。按照不同的氧化方式，可以把這種儀器分為重鉻酸鉀氧化和非重鉻酸鉀氧化兩種方式。
水質在線監測系統的管理和運營能夠有效保障在線監測工作的正常進行，所以，必須要使在線監測系統的運營變得具有規范性。環境保護相關部門應該對運營單位開展資質認可行動，對相關的運營人員要展開持證上崗的考核，促使水質在線監測系統逐步變得規范化。這樣才能促進城鎮供水水質在線監測工作的有序進行。