動物細胞的許多成分通過轉移到膜內或嵌入膜的部分而被回收。例如，在胞吞作用(更具體地說，巨胞飲作用)中，細胞質膜的一部分收縮形成囊泡，最終與細胞內的細胞器融合。如果沒有主動補充，質膜的尺寸會不斷減小。據認為溶酶體參與這種動態膜交換系統，并由內體逐漸成熟過程來形成的。
溶酶體蛋白的產生表明了一種溶酶體的維持方法。溶酶體蛋白基因在細胞核中轉錄。mRNA轉錄物離開細胞核進入細胞質，并在那里被核糖體翻譯。新生肽鏈轉移到粗面內質網中，在那里被修飾。溶酶體可溶性蛋白質通過CLN8介導的COPII包被的囊泡募集離開內質網， 進入高爾基體。在高爾基體中，一個特定的溶酶體標記——甘露糖6-磷酸——被添加到肽中。這些標記的存在允許高爾基體中甘露糖6-磷酸受體的結合，這種現象對于正確包裝進入溶酶體系統的囊泡至關重要。
離開高爾基體后，溶酶體中充滿酶的囊泡與晚期內體融合，后者是一種相對酸性的細胞器，其pH約為5.5。這種酸性環境導致溶酶體酶與甘露糖6-磷酸受體分離。然后，酶被裝入囊泡中，以便進一步運輸到已建立的溶酶體中。 晚期內體本身最終可以成長為一種成熟的溶酶體，這可以通過溶酶體向內體運輸內體膜成分這一過程來證明。