(1)與氨基糖苷類合用，可增加產生耳毒性、腎毒性和神經肌肉阻滯作用的可能性，發生聽力減退，停藥后仍可繼續進展至耳聾，可能是暫時性的，但往往呈永久性。神經肌肉阻滯作用可導致骨骼肌軟弱與呼吸抑制或麻痹(呼吸暫停)，用抗膽堿酯酶藥或鈣鹽可能使阻滯恢復。
(2)與兩性霉素B、萬古霉素、桿菌肽、巴龍霉素、環孢菌素，卡氮芥、順鉑、布美他尼、依他尼酸、呋塞米同時或先后應用可增加耳毒性及腎毒性發生的可能性，同用時需進行聽力和腎功能測定。
(3)抗組胺藥、布克利嗪（buclizine）、賽克利嗪、美克利嗪(meclozine)、吩噻嗪類、噻噸類、曲美芐胺，與卷曲霉素合用可能掩蓋耳鳴、頭昏或眩暈等耳毒性癥狀。
(4)卷曲霉素與抗神經肌肉阻滯藥合用時可拮抗后者對骨骼肌的作用，因此在合用的當時或合用后，需調整抗肌無力藥的劑量。
(5)與乙硫異煙胺合用時，可能加重副作用。
(6)甲氧氟烷或多粘菌素類注射劑與卷曲霉素同時或先后應用時，腎毒性或神經肌肉阻滯作用可能增加，故應避免合用；神經肌肉阻滯作用可致骨骼肌軟弱和呼吸抑制或麻痹(呼吸暫停)；在外科手術過程中或手術后兩者合用時亦應謹慎，用抗膽堿酯酶藥或鈣鹽有助于阻滯恢復。
(7)本品與阿片類鎮痛藥合用時，兩者的中樞呼吸抑制作用可能相加，導致呼吸抑制作用加重或抑制時間延長或呼吸麻痹(呼吸暫停)，必須密切觀察和隨訪患者。
