一、原理
RNA包括rRNA、tRNA和mRNA等,大部分通常是以核蛋白復合物的形式存在的。通過SDS、苯酚處理使蛋白質變性并沉淀。利用LiCl溶解雙鏈DNA的特性去除DNA,經乙醇沉淀得到總RNA。純度高、完整性好的RNA,即可用于Northern雜交、純化mRNA、cDNA合成和體外翻譯等進一步的實驗。
提取RNA過程中預防RNase對RNA的降解至關重要。由于RNA酶也是蛋白質,所以使所有蛋白質迅速徹底地變性同時防止了RNase對RNA的降解。可通過二乙基焦碳酸鹽DEPC)處理所使用的器皿、水以及部分溶液,并在提取體系中加入RNase抑制劑等來抑制內源、外源的RNase活性。
二、目的
了解提取植物總RNA的原理和意義,掌握快速制備植物總RNA的基本方法。
三、材料、試劑
1、幼嫩的植物葉片。
2、液態氮2L。
3、Tris-Cl平衡酚(pH 8.0)。
4、苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1)混合物。
5、氯仿。
6、3M NaAc(pH 5.3)。
7、RNA提取緩沖液:0.2M Tris-HCl(H 9.0), 0.4M LiCl, 25mM EDTA, 1%SDS。
8、2M LiCl。
9、0.2M Tris-HCl, pH 9.0。
10、0.4M LiCl。
11、95%乙醇。
12、75%乙醇。
13、瓷研缽。
14、無RNase的重蒸水。
四、操作方法
1、稱取植物材料0.1g。
2、在瓷研缽中倒上液氮,將材料剪成小塊放入液氮中,待液氮稍少時充分研磨材料,中間可補充少許液氮。
3、將粉末刮入1.5ml離心管,加入0.55ml提取液劇裂振搖2-3分鐘。
4、加入0.55ml苯酚-氯仿-異戊醇混合液,振搖1分。
5、13000rpm離心10分鐘。
6、將水相轉到一個新的離心管中,重復第4-5步2次。
7、將水相轉至新的離心管中,加入0.55ml氯仿振搖混勻,以除去痕量的苯酚。
8、13000rpm離心3-5分鐘。
9、將水相轉移至新離心管中,加55ul 3M NaAc(H 5.3)和2倍體積的95%乙醇。-20℃下靜置20分鐘。
10、4℃條件下13000rpm離心15分,用移液槍吸去上清液。
11、加0.3ml2MliCl,用移液槍輕輕吹打使雙鏈的DNA溶解,冰浴上靜置10-30分鐘。13000rpm離心15分鐘,棄去上清液。
12、加0.3ml無RNase的重蒸水,振搖使沉淀溶解。
13、加30ul3M NaAc(pH5.3)和0.7ml 95%乙醇,混勻。-20℃冰箱內放置20分鐘,13000rpm離心15分鐘。
14、棄去上清液,加入0.5ml 75%乙醇,13000rpm離心5分鐘。
15、小心吸去上清液,真空干燥10分鐘。
16加入50nl無RNase重蒸水重懸RNA,然后置于-20℃保存。
17、用紫外分光光度計則定260nm和280nm處的光密度。對純的RNA來說。OD260/OD280為2.0,1OD260約為40mg/mlRNA。
18、RNA瓊脂糖變性膠分析