攝入不足、酗酒而導致維生素B2的缺乏。另外某些藥物，如治療精神病的普嗎嗪、丙咪嗪，抗癌藥阿霉素，抗瘧藥阿的平等，因會抑制維生素B2轉化為活性輔酶形式，故長期服用這些藥物時會引發維生素B2的缺乏癥。
通常微度缺乏維生素B2不會出現明顯癥狀，但是嚴重缺乏維生素B2時會出現如下癥狀：
1、口腔-生殖綜合征（orogenital syndrome）。
口部：嘴唇發紅、口角呈乳白色、有裂紋甚至糜爛、口腔炎、口唇炎、口角炎、口腔粘膜潰瘍、舌炎、腫脹、疼痛及地圖舌等；
眼部：瞼緣炎、怕光、易流淚、易有倦怠感、視物模糊、結膜充血、角膜毛細血管增生、引起結膜炎等；
皮膚：丘疹或濕疹性陰囊炎（女性陰唇炎）、鼻唇溝、眉間、眼瞼和耳后脂溢性皮炎；
陰囊炎：最常見，分紅斑型、丘疹型和濕疹型，尤以紅斑型多見，表現為陰囊對稱性紅斑，境界清楚，上覆有灰褐色鱗屑；丘疹型為分散在群集或融合的小丘疹；濕疹型為局限性浸潤肥厚、苔蘚化，可有糜爛滲液、結痂。
維生素B2的欠缺會導致口腔、唇、皮膚、生殖器的炎癥和機能障礙，稱為核黃素缺乏病。
2、長期缺乏會導致兒童生長遲緩，輕中度缺鐵性貧血。
3、嚴重缺乏時常伴有其它B族維生素缺乏癥狀。
與維生素B6、維生素C及葉酸一起作用，效果最佳。由于核黃素溶解度相對較低，腸道吸收有限，故一般來說，核黃素不會引起過量中毒。
當人體缺乏B2時，人體腔道內的粘膜層就會出現問題，引起粘膜病變，造成粘膜細胞代謝失調。具體表現是粘膜變薄、粘膜層損傷、微血管破裂。對于女性生殖器官所造成的傷害則更為嚴重，最典型的癥狀如陰道壁干燥、陰道粘膜充血、潰破，直接影響性欲，造成性欲減退、性不適。由于內環境的病理性改變可導致疼痛，畏懼同房，即使勉強過夫妻生活，也無愉快感產生，反會造成女方精神極度緊張恐慌，加劇痛感，長此下去必然影響夫妻和睦。
夫妻生活中一旦出現上述情況，可能就是由于女方缺乏B2造成。治療方法首先是，多食些富含維生素B2的食物即可，如奶類及其制品、動物肝腎、蛋黃、鱔魚、胡蘿卜、香菇、紫菜、芹菜、橘子、柑、橙等。如果癥狀比較嚴重，也不可怕，可按時適量服用B2片，每日3次，每次10毫克(相當于2片)，至癥狀改善后停藥。