DNA或RNA先轉移并固定到硝酸纖維素或尼龍膜上,與其互補的單鏈DNA或RNA探針用放射性或非放射性標記。在膜上雜交時,探針通過氫鍵與其互補的靶序列結合,洗去未結合的游離探針后,經放射自顯影或顯色反應檢測特異結合的探針。