林木種子的品質與造林、綠化用種計劃息息相關，而在林木種子的儲藏期間，由于儲藏環境不達標，造成的林木種子品質下降或是損失的事件時有發生，不僅造成了嚴重的資源浪費，同時也影響了造林、綠化等工作的有序開展，因此選擇經濟、合理的林木種子儲藏方案就是目前重要的一項內容，而林木種子標準樣品庫可以為林木種子的儲藏創造合適的環境，保持種子活力，達到安全儲藏的目的。
但是由于林木種子標準樣品庫的在我國的應用歷史并不長，因此很多人對此持懷疑的態度，甚至會質疑林木種子儲藏為什么要使用林木種子標準樣品庫？而長期以來林木種子儲藏多是以來常溫庫儲藏，雖然在一定程度上能降低林木種子的損失，但是其品質的下降和種子損失依然是不可避免的。在這一點上，林木種子標準樣品庫具備明顯的優勢。
另外常溫庫儲藏林木種子，不僅儲藏效果較差，而且管理較為麻煩，比如在庫房需要進行防潮防漏處理、定期清理庫房，通風等，因此可以說由于種子在儲藏期間的管理不善，也造成了較為嚴重的種子損失。對于現代林木種子儲藏來說，這種儲藏方式對于工作人員有較高的要求，要求他們具備較高的種子儲藏技能，而這也給林木種子儲藏工作的開展帶來了一系列的困難。
而林木種子標準樣品庫的應用則不同，它利用當前先進的環境控制技術，實現了庫體環境的實時監測和控制，為林木種子的儲藏創造合適的環境條件，能夠用來長期儲藏林木種子，使這些種子在幾十年、乃至數百年之后仍具有原有的遺傳特性和很高的發芽力，同時林木種子標準樣品在管理和應用方面非常簡單，屬于智能化的全自動儀器設備，因此對于操作人員的要求也比較低，因此非常適合在現代林木種子儲藏中推廣使用。