人類基因組測序工作的完成為人類生命科學研究開辟了一個新紀元,對整個生物學研究以及我們自身都具有深遠的影響和重大意義。對于生命奧秘的探索,如果說此前人們還一直在混沌中碰壁,那么人類基因組計劃的完成無疑是一線曙光,它開辟了從基因組層面上整體研究生命現象的新領域,并為這一領域的研究照亮了方向,帶動了整個基因組學相關的系統研究。
成都昂邁思科技有限公司是一家專業級的數據服務公司,但服務的對象卻是有一些“特殊”,因為他們服務的對象不是普通人或者一般的企業,而是科學家,一群專注于研究生命科學的人。昂邁思科技是一家生物基因測序數據服務公司,公司目前主要的基因測序服務包括了“基因組De Novo測序”、“基因組重測序”、“全基因組甲基化(WGBS)測序”、“外顯子捕獲測序”、“真核有參(無參)轉錄組測序”、“長鏈非編碼RNA測序”、“10X Ginomics Linked Reads”、“BioNano光學圖譜”等生物基因測序服務。
在基因檢測里,首先是樣本采集,然后送往實驗室構建上機文庫、進行上機測序,下機后得到的數據只是原始的序列結果。其次通過成熟的信息分析流程,數據轉換為具有分子生物學意義的基因突變或基因組變異的信息。最后經過專業人員進行報告解讀,將基因突變或基因組變異數據進一步提取為具有臨床指導和科學研究意義的報告。目前樣本處理和建庫都有成熟的方法和試劑,依賴于一系列的技術革新上機測序的成本也不斷在下降當中。
在數據處理方面,由于基因組數據量巨大,因此生物信息學的數據分析需要強大的計算處理能力來進行分析操作,為此昂邁思科技不僅使用自主擁有的強大計算機集群來進行數據的極速穩定處理,還與國家超算中心達成合作,使用全球最快計算機之稱的“天河二號”作為備用的計算機和服務器。因此跨過了大數據量導致的數據存儲困難和計算速度慢的障礙。
在生物信息分析方面,針對目前已有的常規產品,昂邁思科技已經建立起一套完善的分析流程,并有專業的生物信息人才進行流程的維護與優化。原始的生物信息數據通過完善的分析流程可以達到一鍵操作給出項目標準分析結果。因此生物信息分析人員有更多的精力與時間去針對不同的項目特點,不同的研究內容為相關的科研工作者提供深度的個性化分析服務。
未來在基因測序相關的科研或醫療研究當中,隨著硬件技術的不斷革新,其他部分的成本將持續下降,具有針對性或專業程度高的研究項目,在數據分析和報告解讀和將成為測序服務中的關鍵項,這部分的成本比例將有所提高。
昂邁思科技提供的是專業的定制數據整合服務,包含各種個性化和深度的數據分析服務。具體項目包括功能基因組組學、結構基因組學、表觀基因組學、群體遺傳學、細胞生物學等的基因測序數據可視化處理,以及最便捷直觀的醫學及體檢報告的檢測結果可視化,3D成像后期處理等,讓科研工作者或醫療工作者更直觀、明晰的了解分析結果。
最后,在基因數據信息分析完成之后,通常會得到變異信息的列表。科研人員在海里的信息當中去尋找到與研究相關的突變也是一項費時費力的工作。盡管目前有公司開發相應的軟件程序和建立的數據庫希望能替代這部分的人工投入,但是更多的只是起到輔助功能,真正進行報告解讀和遺傳咨詢的還是需要專業具有經驗的人才才能完成。這需要有臨床醫學、基因組學、人類遺傳學等復合知識背景人才,而昂邁思科技不止自主擁有一支高技術水平的分析團隊,還有四川農業大學-加拿大農部聯合培養博士,四川農業大學作物遺傳育種博士,美國加州戴維斯大學博士后王際睿做技術顧問,并且與四川農業大學合作,有數名生物專業在讀研究生做輔助分析。豐富的生物信息以及數據分析專業技術保障了昂邁思科技可以很好的為廣大科研工作者提供高質量服務。