抗甲狀腺微粒體抗體的靶抗原為甲狀腺微粒體，其主要成分是由933個氨基酸組成的相對分子質量為84000~105000的甲狀腺過氧化物酶（TPO），并表達在細胞的表面。該酶可與甲狀腺球蛋白協同作用將L-酪氨酸碘化，并將碘酪氨酸和二碘酪氨酸結合成為甲狀腺激素T3、T4和rT3。大多數文獻已經將TMA改名為TPO抗體。但因為TPO抗原發現較晚，故臨床上仍將A-TM和A-TPO視為同義詞。抗甲狀腺微粒體抗體主要以IgG類為主，測定該類抗體的主要適應癥為自身免疫性甲狀腺疾病，對該類疾病有診斷意義。
